Генетика по сей день удивляет своими возможностями и широким изучением генетики человечества и других организмов. Наука не обходится без специфической терминологии. Генотип — что это значит? Под термином понимают набор генов одного организма, хранящиеся в хромосомах каждой из клеток. Генотипы заболеваний представляют собой типы вирусов, обладающие отличиями в своих генах. Имеют они собственные подтипы, которые обладают постоянными мутациями и изменениями.
Гепатит типа С имеет свою особенность, активно изменяет генетическое строение. Возможность постоянной мутации во многом затрудняет лечение патологии. Существует от 6 до 11 генотипов заболевания.
Только 6 штаммов признано официально. Генотипы гепатита С имеют официальное обозначение с помощью цифр (1-6), они имеют немалое количество своих подтипов и встречаются по всему земному шару. Генотип 4 более распространен в северной части Америки, а 6 генотип в южных широтах Африки.
Различия можно видеть и в возрастной категории пациентов. К примеру, подтип 1в можно встретить у взрослых людей в 52%, в детском возрасте он встречается лишь в 25%. Генотипы 5 и 6 у детей вовсе не были выявлены.
Какие бывают генотипы вируса гепатита С?
Генотипы – это типы вирусов, которые отличаются друг от друга набором генов. Они могут иметь свои подтипы (квази-типы), которые из-за своего неустойчивого генетического материала постоянно мутируют и видоизменяются.
Генотипы гепатита С условно обозначаются цифрами от 1 до 6, неравномерно распределяются по всему миру и имеют большое количество подтипов.
Распределение генотипов HCV в мире
Согласно статистическим данным, полученным ВОЗ из разных стран мира, генотипы 1-3 были зафиксированы во всех уголках нашей планеты, тогда как генотип 4 наибольшее распространение получил в Северной Америке, а генотип 6 – в Южной Африке.
Если говорить о возрастном распределении, то ученые отмечают, что у взрослых преимущественно встречается квази-тип 1в (52%), тогда как у детей он диагностируется только в 25% случаев. При этом генотипы 5 и 6 у детского населения вовсе не были выявлены.
Интересно, но в последние годы наблюдается тенденция к увеличению уровня распространения генотипа 2 и снижению уровня квази-типа 1в.
Приблизительно в 9% случаев в крови у больных диагностируется более одного вида вируса HCV. В таком случае говорят о смешанном генотипе гепатита С.
Особенности генотипов гепатита С
Диагностические мероприятия
Отсутствие яркой клинической картины гепатита С обуславливает необходимость применения точных диагностических методов, позволяющих выявить наличие в крови определённого вируса. Направление на обследование выдает инфекционист или гепатолог, которые могут более подробно рассказать о том, как определить патогенную флору.
Анализ на генотип включает:
- Проведение ультразвуковой диагностики. Позволяет выявить изменения в самом органе, которые диагностируют развитие именно гепатита С. Яркий признак – это наличие стеатоза, то есть появление жировых клеток в ткани печени.
- Исследование крови – ПЦР-диагностика. Позволяет обнаружить антитела к возбудителю и выделить его РНК.
Перед изучением биологического материал важно соблюдать определенные правила: не курить непосредственно перед посещением лаборатории, за несколько до процедуры отказаться от употребления алкогольных напитков. Иногда с помощью анализа крови инфекция не выявляется. Узнать о том, заражён человек или нет, поможет повторное обследование. Определение вируса бывает затруднено из-за:
- нетипичного возбудителя,
- низкой концентрации РНК возбудителя в исследуемом материале,
- наличие нескольких генотипов (именно поэтому столь важным является генотипирование, позволяющее выявить конкретный подтип патогенной микрофлоры),
- неправильных условий сдачи анализа или хранения материала.
Генотип 1
Генотип 1 имеет подтипы a, b, c. Он встречается во всем мире, однако особенное распространение получил в странах бывшего СССР.
В России, Украине и Белоруссии наибольшее распространение получили подтипы 1а и 1b.
Главной особенностью генотипа 1 является то, что он очень трудно поддается лечению. Дело в том, что в отличие от других штаммов вируса первый генотип может легко приспосабливаться к новым условиям и методам лечения. Именно поэтому многие врачи, отвечая на вопрос, какой генотип гепатита С самый опасный, указывают на генотип 1.
Среди всех подвидов 1б является самым страшным, поскольку в 90% случаев он переходит в хроническую форму, которая грозит многочисленными осложнениями.
Как доказывает медицинская практика, едва ли не единственным действенным средством лечения является использование Интерферона с Рибавирином. Согласно статистическим данным, эффективность данной схемы лечения позволяет достичь положительного результата в 50% случаев. При этом длительность лечения квази-типов 1а и 1б составляет не менее 48 недель.
Успешность терапии зависит от таких факторов:
- Давность заболевания. Для пациентов, у которых давность заболевания составляет более пяти лет, прогноз неутешительный. В данном случае медикаментозное лечение проходит очень трудно, а его продолжительность значительно увеличивается.
- Количество вируса в крови. Чем меньше вирусная нагрузка на организм человека, тем успешнее проходит терапия.
- Соблюдение правильного образа жизни. Отказ от алкоголя и других вредных привычек, а также соблюдение правильного питания и диеты существенно повышают шансы на выздоровление.
Что такое фенотип в биологии
Это совокупность наследственной информации в организме. Иными словами, это сумма генов, образующая единую систему.
В отличие от генофонда, он описывает не весь вид, а отдельную особь.
Фенотип (англ. phenotype) в биологии — это совокупность признаков, формирующихся на основе генотипа. Однако, под влиянием окружающей среды, набор свойств может меняться, из-за чего появляются индивидуальные различия.
По свойствам организма не всегда можно понять, какой генотип у особи. У организмов может быть одинаковый набор свойств даже при разном наборе генов. Например, у красного цветка может быть генотип и «АА», и «Аа». В данном случае для определения набора генов применяется анализирующее скрещивание.
Hepatitis C Virus (HCV) опасен не только скрытыми симптомами. Патология может годами разрушать печень человека и при этом не вызывать значимых клинических проявлений. На основании отличий в порядке расположения аминокислотных остатков, специалисты выделяют несколько разновидностей вирусного патогена.
Генотипы гепатита С разнятся по симптоматике, скорости прогрессирования некротических поражений печени и вероятности развития осложнений. Именно генотип является основополагающим фактором подбора эффективной терапии.
Периодически в медицинской литературе появляется информация об открытии новой разновидности вирусной инфекции. В итоге данные, сколько генотипов у гепатита С, разнятся.
Некоторые специалисты называют цифру 11 (без учета квази-типов).
Но практикующие гепатологи руководствуются рекомендациями Всемирной Организации Здравоохранения (ВОЗ), в соответствии с которыми выделяют 6 генотипов вируса HCV.
Молекулярные методы диагностики позволяют с высокой точностью изучить структуру патогена, обнаруженного в плазме крови или биоптате тканей печени пациента. Таким образом специалисты могут с высокой точностью установить тип патогена, и на основании полученных результатов доктор назначает соответствующую терапию.
Вирус гепатита С – одноцепочечный вирус из рода Hepacivirus, с диаметром 50 нм. Он отличается высокой скоростью распространения.
Генотипы ВГС представляют собой генетически различные группы вируса, возникшие в процессе его эволюции. Генотипирование – это способ поместить вирус гепатита С в одну из категорий, основанных на аналогичных генах.
- Вирус гепатита С имеет одиннадцать генотипов с метками от 1 до 11. Существуют также подтипы, обозначенные буквами, к примеру, генотипами 1a и 1b;
- Согласно классификации Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) существует 6 основных генотипов вируса, имеющих клиническое значение;
- У большинства людей есть один доминирующий генотип вируса гепатита С, но одновременно возможно иметь более одного. Такое состояние называется смешанной инфекцией.
Генотип вируса обычно остается неизменным. Генетические изменения или мутации могут происходить случайным образом или в ответ на воздействие окружающей среды. Некоторые мутации безвредны, но другие могут влиять на то, насколько хорошо пациент реагирует на лечение.
Новые методы лечения гепатита С включают в себя два или более препаратов для предотвращения резистентности к лекарственным средствам, ориентируясь более чем на один шаг в жизненном цикле вируса. Однако, если пациенты пропускают дозы лекарства, это может привести к генетическим мутациям, которые вызывают резистентность к лечению ВГС.
Знание генотипа гепатита С – важная информация, которая может помочь пациентам и врачам найти наиболее эффективное лечение, спрогнозировать его течение и длительность.
Из-за географической привязки отдельных генотипов вируса гепатита С их генотипирование может быть полезным инструментом для отслеживания источника вспышки заболевания. К примеру, генотипирование и молекулярная характеристика изолятов ВГС послужили доказательством возможности передачи вируса гепатита С во время колоноскопии.
Все генотипы гепатита С вызывают примерно одинаковое повреждение печени. Однако люди, инфицированные генотипом 1, особенно подтипом 1b, могут иметь больший шанс развития цирроза или сильного рубцевания печени, чем больные с другими генотипами. А генотипы 1b и 3 могут увеличить риск развития рака печени.
Генотипы гепатита С являются важными эпидемиологическими маркерами. Различия между генотипами в патогенности неясны и не доказаны. В сочетании с другими маркерами, такими как количественная оценка РНК ВГС, генотипирование может быть полезным при лечении хронического гепатита C и для выбора кандидатов для лечения интерфероном.
https://youtu.be/2DkEnqmOI_w
Человек любой расовой или этнической группы может иметь какой-либо генотип или подтип гепатита. Однако некоторые генотипы гепатита С могут быть более распространены в тех или иных странах или у этнических групп.
Люди, которые путешествуют между регионами, где чаще встречаются разные генотипы, могут подвергаться воздействию различных генотипов ВГС, что приводит к смешанной инфекции.
Хотя гепатит С 1, 2 и 3 генотипов получил распространение во всем мире, его относительная распространенность варьируется от одной географической области к другой. Наиболее распространенными генотипами в России, Европе и Соединенных Штатах являются подтипы 1a и 1b.
Генотип 2
Имеет подтипы a, b, c. Он распространен во всем мире, однако в отличие от других генотипов встречается значительно реже, характеризуется низкой вирусной нагрузкой и медленным течением воспалительного процесса. В случае диагностирования генотипа 2 гепатита С осложнения наступают крайне редко, а выздоровление происходит в 90% случаев. Именно поэтому его нередко называют «щадящим».
Лечение осуществляется при помощи комбинированного приема Интерферона и Рибавирина. Также эффективность терапии наблюдается в случае использования препаратов прямого противовирусного действия – Софосбувира, Даклатасвира, Ледипасвира.
Генотип 2 – самый «щадящий» тип вируса HCV
Генотип 3
Имеет подтипы a и b. Он встречается во всем мире, однако наибольшее распространение имеет на территории стран бывшего СССР. Также зафиксировано немало случаев инфицирования на территории Австралии и Южной Азии.
Генотип 3 считается одним из самых изученных типов заболевания. Он достаточно хорошо поддается лечению: в 80% случаев при правильно подобранной медикаментозной терапии удается достичь желаемого эффекта. Длительность лечения составляет не менее 24-х недель.
Лечить гепатит С генотипа 3 можно с помощью противовирусных препаратов нового поколения. Исследования показывают, что наиболее эффективным является использование Рибофлавина в комплексе с Интерфероном. Также ученые отмечают, что квази-тип 3а хорошо поддается лечению такими препаратами, как Веро-Рибавирин и Интераль.
Если же генотип 3 гепатита С не лечить, возможно появление опасных осложнений. Прежде всего речь идет о таких осложнениях:
- Фиброз печени. Согласно данным исследований швейцарских ученых, фиброз печени чаще всего наблюдается у больных гепатитом с квази-типом 3а. И хотя на сегодняшний день не существует препаратов, с помощью которых можно полностью победить заболевание, при своевременном лечении патологические процессы в печени можно приостановить на долгие годы.
- Стеатоз. Замечено, что у пациентов с вирусным гепатитом С с генотипом 3 стеатоз развивается в 70% случаев.
Стеатоз печени – одно из самых распространенных осложнений, которое наблюдается у больных с вирусом HCV генотипа 3
Генотипы 4, 5, 6
Генотип 4 имеет наибольшее количество квази-типов (a, b, c, d, e, f, h, i, j) и чаще всего встречается в Северной Африке, преимущественно в Египте. Пятый и шестой генотипы имеют всего лишь по одному квази-типу – 5а и 6а. При этом если 5а преимущественно преобладает в ЮАР, то 6а – распространен в Азии.
Генотипы 4, 5, 6 являются малоизученными, однако известно, что инфицирование происходит через кровь или во время незащищенного полового акта.
Поскольку эффективная схема лечения гепатита С с генотипами 4, 5, 6 не разработана, используются традиционные препараты Интерферон и Рибавирин, а также дорогостоящие лекарственные средства прямого действия – Софосбувир, Даклатасвир, Ледипасвир.
Зачем нужно определять генотип?
Определение генотипа (генотипирование) – это один из самых важных анализов, которые используются для диагностики гепатита С.
Главными задачами генотипирования являются:
- определение схемы лечения, выбор препаратов, их дозировки;
- прогнозирование течения болезни и эффективности выбранной терапии;
- прогнозирование длительности лечения.
Генотипирование напрямую влияет на выбор схемы лечения заболевания
Современные медицинские технологии позволяют с максимальной точностью определить генотип гепатита С. Для этого используются полученные результаты исследований крови и плазмы.
Наиболее эффективными методами генотипирования гепатита С при исследованиях крови и плазмы больного являются:
- прямое секвенирование;
- полимеразная цепная реакция;
- обратная гибридизация с зондами на мембране.
Многие пациенты задают вопрос, где сдать анализ на генотип гепатита С. Если речь идет о распространенных генотипах 1-3, то сегодня подобные исследования проводят практически все местные лаборатории (Инвитро и т.д.). Если же генотип HCV не удалось узнать и необходимо дополнительно сдать кровь на специфические штаммы 4-6, исследования проводятся в специализированных центрах, которые расположены в крупных городах.
Как подготовиться к сдаче анализа, и сколько он стоит?
Любой анализ требует определенной подготовки, и генотипирование не является исключением. Диагностический метод требует следующих подготовительных мер:
- Отказа от жирной и тяжелой пищи за сутки до явки в лабораторию
- Отказа от пищи вообще за 8 часов до сдачи образца крови
- Воздержания от употребления спиртных напитков и табачной продукции накануне сдачи анализа
- Избегания стрессовой или физической перенагрузки
Сдать образец крови из вены для генотипирования пациенту следует в утренние часы. Анализ на выявление генотипа можно сдать в любой клинической или независимой лаборатории.